我爸妈95年买了一套单位危旧房，但是当时房产证没办理下来，我爸妈98年感情不和离婚后

我爸妈95年买了一套单位危旧房，但是当时房产证没办理下来，我爸妈98年感情不和离婚后，我妈在单位申请了单位危旧房，99年我爸妈一起买的危旧房的房产证下来了。因为爸妈早已离婚不联系，妈妈也一直不知道房产证有她的名字，直到最近老爸要办理把房子过户给我才发现妈妈名下有两套房，这个怎么弄？妈妈可以退出和我爸爸一起买的房子的名字吗？因为当时离婚协议是说妈妈净身出户，房子都归爸爸所有的。如果要妈妈退出她自己单位买的危旧房她就没地方住了，不可能的哈，如果不办理两套房问题就办理不了房子过户问题，头大哈，不知道怎么办。