宅基地使用权纠纷

我家二块宅基地共180平方米于1999年获批，兄弟俩一起报批，建时我出了一千四百元，一个未出嫁的姐姐给了3000元，其余的是家里出的，家里还有有父母兄嫂，2001年冬建好一楼，并领到了二本《农村集体土地使用证。》兄弟俩一人一本！十年后，我亲哥把我的《农村集体土地使用证》毁掉，并买通国土所国土局的人，连同档案资料都毁掉，用侄子的名字重新申请并获得国土局颁发《农村集体土地使用证》2015年被我发现，我找到了我1999年的农村集体土地申请呈批表复印并提交国土局，国土局于是注销了侄子的《农村集体土地使用证》！我哥不死心又把我名下的宅基地登记到一本1990年发的农村集体土地使用证的第三处，土地使用者写的是我亲哥的名字，在变更登记的第三处写了此宗地属于钟凌星（我的名字）。我再次申请要求国土局注销该登记，国土局给了书面回复说，该登记是违规登记，应予以纠正并注销！今年4月1号国土局书面回复，已经注销该登记。但未纠正没有登记到我名下，我向国土局申请登记到我名下。国土局回复说因地上建筑物有纠纷，所以不能给我登记发证。我想咨询，我该如何做，才能登记到我的名下。