本案是否过了诉讼时效以及怎么确定被告

H房地产开发公司与Y建筑工程公司于2006年6月3日签订T商住楼《工程承包合同书》。约定H公司将T商住楼发包给Y公司施工，Y依约完成该楼土建工程，H也支付了工程款。进入装修阶段，Y垫资施工，并完成80%的装修工程量，Y公司因建设资金严重紧缺，不能依时支付装修款，自2006年12月起，工程被迫停工。双方办理工程交工后，H公司对Y公司的结算要求一直置之不理。2009年3月，S集团将被告H公司的财产T 商住楼作为抵押物向广州市农村信用社进行抵押贷款。 
   补充：
   H公司一直未与Y公司决算，工程价款具体数额不好确定。建议先以合同约定价款和垫支款项先主张权利，并寻求时机促使对方进行决算。
   
   经调查了解：H公司是S集团公司于2003年10月15日，在北京注资1200万兴办的有限责任公司，用语建设运作T商住楼的项目公司。2009年6月7日，H公司取得T〈房屋所有权证〉。2009年4月30日，S公司向北京市农村信用社贷款2000万，H公司用该楼为此贷款作抵押担保，并签订抵押担保借款合同。
   我想问本案是否过了诉讼时效？
   如何确定被告？