建筑工程合同纠纷

你好！咨询你个建筑工程纠纷问题：签定第一份合同时，乙方公司没有注册，用了个没注册的合同专用章且签了名。工程开工后，由于乙方没按合同要求付款，我方拒绝垫资，工程停工。后乙方注册，则与我方签定了另一份对我方不利的合同且盖公章签名。我想问，关于第一份合同，是否还有效（第二份合同中有以第一份合同里某条款为依据）？他们是否涉嫌诈骗？我方可以从哪些方面打官司比较好？

大致经历过程：
09年底，签定合同（乙方未注册公司，用未注册的合同专用章和签名）——我垫资方开工——付款时间到，乙方未按时付款——我方催促，付部分款——我方继续施工，2月底乙方注册——三月中付款时间到乙方未付款，并签定合同附属协议，写明如若乙方在违约不付，我方拒绝垫资或终止合同，付部分款——叫我方写总收条，撕毁零星（包括未注册前）收条——我方继续施工——时间到乙方又不付款.............——5月签定第二份不利我方合同，我方继续施工——乙方不付款——我方停工——乙方起诉我方。  麻烦您帮帮忙给点意见，谢谢！