我在青岛，我想咨询一下关于劳动仲裁的问题，我与公司7月初签了一份一年的劳务合同试用期三个月，转正后2500，五险一金，合同我签完字后寄回总公司重庆盖章后就没有给我，现在公司说总公司规定签约时应届毕业生入职需要三个月见习三个月实习，现在给我转正转早了，要在我下个月工资扣除三个月见习期多发的工资，另外，他们发工资时又已总公司统一划分了工资等级为名，我转正后工资只有2400，现在我没有合同在手，下个月他们这样扣我工资我可以申请劳动仲裁么，概率怎么样呢？谢谢
----------------------------------------问题补充：--------------------------------------------------
我没有合同在手也行是么？麻烦一下具体的流程是怎么样的呢，是他在扣了我工资以后我去申请是么？