您好，我是广东某农村自建房屋主，2010年12月刚建好新房，2个月不够，2011年2月份一场雨水过后，发现我家露台、屋顶大面积渗水，渗漏面积有30平方米左右，而且分散。之前已经支付给包工头（承建商）3万工程款，现在剩下2万5千元工程款未支付，现在要求包工头（承建商）找有资质的修补漏公司修补好后，扣除该修补费后支付余下的工程款，因包工头（承建商）觉得修补漏费用要1万多太贵不愿意支付，只答应扣1000元了事，多次商讨未果，在年二十八还带了10多人到我的老婆娘家恐吓，也报了警。现在居会会调解也不成功，包工头（承建商）还扬言继续恐吓，因为当初大意没有签建房协议，请问现在我可以怎么处理？可以单方面向法院申请房屋的司法鉴定吗？
----------------------------------------问题补充：--------------------------------------------------
请问可以先单方面向法院申请房屋的司法鉴定后，看过鉴定结果再起诉吗？还是要起诉后才能申请房屋司法鉴定？如果要起诉，我应该从哪方面提出自己的理由来起诉对方呢？毕竟我还是欠包工头一小部分工钱，还是让包工头起诉我比较合适些呢？如果想先申请司法鉴定后看结果再起诉对方，请问怎样应该走什么流程？请赐教