我和村委于2000年签了一份厂房转让协议，在合同规定的时间内已交齐了房款，并按合同规定每年支付了土地使用费，一直到2012年。因村里换了新主任，向法院提起诉讼要收回厂房，理由是没经过村民大会，和房子没有过户。请教各位老师，村委的要求是否合法合理?我该怎么做?
----------------------------------------问题补充：--------------------------------------------------
2000年签合同的时候，有村委的公章和村主任签字，合同里有根据国家有关规定转让厂房，我们不知道当初是不是经过村民大会，对当初的旧厂房，进行了一百多万的投资。请问合同有效吗？我该怎么维护自己的权力。