二份建房批复一个文号，应以哪份为准？

1996年，某合资企业拟用规划内的一块土地，与公司聘用人员共同出资建一栋楼房。向规划部门申请后，规划部门下达了《关于某某合资公司的建房批复》，该《建房批复》规定，楼房建筑高度三层，建筑面积800平方米。

文件下达后，某合资双方因公司资金等问题不同意与聘用人员共同出资建楼房，但同意规划内的土地转让给聘用人员合伙出资建房。

根据合资双方的意见，公司研究决定，规划内的土地由聘用人合资建房，土地转让给合伙建人，土地转让价格按土地部门评估价格计算。建房申报仍由某合资企业向规划部门申请。

某合资企业再次向规划部门提出《关于某某等同志合伙建房的申请》。规划部门收某合资企的建房申报后，主要领导进行了研究，规划部门办公室人员将“根据×局长与×副局长研究，×副局长交待，该文件内容改为×××等同志合伙建设大楼，同意盖章”记载在已下发的《关于某某合资公司的建房批复》的左上方。

不久规划部门下达了《关于某某同志合伙建设大楼的批复》，批复规定楼房建筑高度六层，建筑面积1600平方米，但文号却与先前向某合资企业下达的《建房批复》文号相同。并由合资企业为合伙建房申办了《建筑工程规划许可证》，《建筑工程规划许可证》规定，楼房建筑高度六层，建筑面积1700平方米。

楼房竣工后实际建筑高度为六层，建筑面积1900余平方（含封闭阳台的面积）。并申领了房产证。办证面积1700余平方（储藏室未办证）。

请问：1.哪份建房批复是有效的？
    2.从法律角度，二份批复一个文号的责任在谁？是建房申报方还是规划方？谢谢！