法医鉴定做假（有证据）如何追究？

一朋友与邻居发生打架纠纷，后来对方去A医院住院7天，7天后出院。在住院的第三天，对方又说前往B医院做了鼻内镜检查，公安局鉴定中心依据A医院的诊断病历和B医院的鼻内镜检查报告（检查报告是机打报告，没有B医院的盖章和医生的手写签名，只有医生的机打签名）鉴定为耳膜穿孔，有新鲜血液，为轻伤。对方要求追究朋友刑事责任。后来，经过朋友取证后发现：1、对方在A医院的出院记录中入院和出院诊断记录中都没有诊断出耳膜穿孔。2、对方在B医院没有任何就医和鼻内镜检查记录（有医院盖章证明），也没有耳膜穿孔的治疗记录。向市刑警队出示证据后，刑警队在B医院也未查证到对方的任何就医和鼻内镜检查记录，但是刑警队却在A医院查到一个会诊单，会诊单上只写了耳膜穿孔，没写有新鲜血液，与鉴定书中的描述不符，A医院中也没有对方的拍片记录及耳部检查记录，且会诊单的日期是住院第二天做出的诊断，但是出院诊断中却没写进去。现在怀疑：1、会诊单是后补的（A医院的出院病例为手写的）。2、轻伤鉴定报告的鉴定依据有假。现在已经掌握对方的医疗材料和鉴定依据作假的死证据。
现在情况：现在案件在市刑警队，刑警队本准备提交检察院提起公诉的，起诉意见书都写好了。但是提供证据后，刑警队却告知：1、根据2014年轻伤新标准，对方本次耳膜穿孔并不能鉴定为轻伤（说是6周内痊愈的不能鉴定为轻伤，应该为轻微伤）。而本次案件实际为2013年做的鉴定，但也有可能会按照2014年标准处理。（2014年，此前我们前往刑警队多次，刑警队一直未提新标准的事情，却在提交证据后告知新标准）
2、刑警队主动提出为双方做调解。（此前派出所已经做过调解，对方不接受调解，要求追究刑事责任，派出所才将案件移交给刑警队，刑警队此前一直告知刑警队没有主动组织调解的义务，他们只处理刑事案件部分，除非双方协商一致或者对方谅解才能撤案，否则一定上交检察院提起公诉。）
现在能清楚的感觉到刑警队是在维护公安局法医鉴定中心相关法医的利益。用所谓的轻伤新标准和主动组织调解的方式来洗清公安局法医鉴定中心的责任。我想问，在调解不成的情况下：1、公安局还是否会将案件提交检察院，还是会直接撤案，以免案件影响力扩大。2、朋友是否应该反过来追究对方的刑事责任而不接受调解？毕竟拔出萝卜带出泥。如果要追究，那么是应该追究对方诬告陷害罪还是追究伪证罪。追究哪个罪名不至于牵连公安机关的法医鉴定中心。（现在有推翻对方鉴定书的鉴定依据的死证据。）如果要追究，应该如何追究，是撤案后直接向公安机关追究对方，还是向检察院还是直接上法院起诉。3、无论是诬告罪还是伪证罪，我能否要求对方赔偿（案件持续一年时间，给朋友带去了巨大的精神压力和时间成本。4、如果撤案，案件还在派出所期间时，朋友被派出所向公安局申请刑事拘留3天，这3天是否可以申请国家赔偿。5、对方洗清其提供假证（B医院的鼻内镜检查报告）方式还有哪些？