如果拆迁公司私自扣去拆迁补偿款合法吗？

沪陕高速公路，江都---六合段高速公路要从我们宅基地经过，所以房子自然被拆了，2010年1月2号下午发放评估表，3号就要求签订协议，我们是4号签订的，22号拆迁公司的人说协议签错了，从上到下都把文件理解错了，需要重新签订（扣除部分补偿款），大家都很气愤，文件是你们制定的，帐又是你们算的，怎么会错呢？都拒绝重签！拆迁公司的人说：“反正钱在我们这儿呢”，请问：如果拆迁公司私自扣去拆迁补偿款合法吗？
按照扬州市拆迁管理办法：“被拆迁房屋的合法建筑面积超过230㎡的部分，不安置住房的，按照房屋重置价格结合成新2.5-3倍的范围给予补偿。”而文件中又规定：“【五类区基准价2400元/平方米】（除一至四类区以外的区域。）要特别强调的是，区位拆迁评估基准价是区位范围内的最低保障单价，如果被拆迁房屋的评估单价低于基准价，一律按照拆迁评估基准价计算。”，我家产权证上超出的25平方米他们是按:604元/m2×25m2×3计算的，还不足2400元/m2怎么会错呢？百思不得其解！请问我应按照“房屋重置价格结合成新2.5-3倍的范围给予补偿”还是按“区位基准价2400元/m2补偿”来维权呢？