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为保证全国征收二氧化硫排污费试点工作的正常进行，根据各地在贯彻实施国家环境保护总局、国家发展计划委员会、财政部、国家经济贸易委员会联合印发的《关于在酸雨控制区和二氧化硫污染控制区开展征收二氧化硫排污费扩大试点的通知》(环发[1998]6号)的过程中提出的问题，现就二氧化硫排污费在征收、管理和使用方面与现行法规、政策如何衔接应用等问题通知如下：
一、开征二氧化硫排污费，是经国务院批准、由四部委联合颁布的新的排污费费种，属专项污染物收费类型。因此，在酸雨控制区和二氧化硫污染控制区内，对于同一废气排污口，除了按国务院发布的《征收排污费暂行办法》(国发[1998]21号)中规定的废气收费标准征收超标废气排污费外，还应按《关于在酸雨控制区和二氧化硫污染控制区开展征收二氧化硫排污费扩大试点的通知》(环发[1998]6号)征收二氧化硫排污费，但国务院《征收排污费暂行办法》(国发[1982]21号)废气收费标准中“二氧化硫”超标排污费不再征收。
二、二氧化硫排污费按月计算，按月或按季征收。征收的二氧化硫排污费要进入排污费征收专户，及时解缴金库，纳入预算内，按二氧化硫污染治理专项资金管理和使用。
三、二氧化硫排污费资金的使用，应根据各地具体使用计划，按照财政核准的资金预算，分别纳入“拨入环保治理资金”、“拨入环保贷款基金”和“拨入环保补助费”会计科目核算，专款专用。
四、二氧化硫排污费的财务核算，在排污费收入一级会计科目下增设二级明细科目“二氧化硫排污费收入”。编制排污费财务报表时，在“环会表二”中“污水排污费”栏下增设“二氧化硫排污费收入”，进行单独核算。
