身份证重号引起的相关问题

我第一代身份证是1996年左右办的，尾数是0012，2001年考学，然后户口给转到学校了，2003年即辍学，2006年的时候因为有机会出国，然后把学校的户口给转回原籍，发现身份证号码和人家重了，只好换号，尾数改为0098，现在我的很多东西都是用这个号码给办的，人家都说是假的，2010年我参加成人远程教育。我想知道，以后如果用人单位，查档案，2006年以前的信息岂不全是假的，如果我找户籍派出所开证明后，档案是否还需修改？派出所证明是否一直跟着档案走。