很纠结的交通事故赔偿问题

今年10月份。我驾驶车辆在国道由南往北行驶对方在市区道路由东往西行驶，交叉路口对方创红灯撞致我车左后门，导致我车的车门、轮毂、轮胎全部损坏。对方车辆也有一定程度损坏。事故发生及时报交警处理。因路口摄像头损坏，事故时间较晚没有目击证人，对方不承认闯红灯。所以没有足够证据的情况下责任划不能明确划分。经交警调解达成书面协议，对方承担全部责任。协议签字后出具事故认定书，对方全责我无责。之后提车修理。我车修理费用是6300元加拖车费516元共计6816元。修理十天后我拿发票，车损公估材料向对方要钱提车，对方提出因他的车有一部分改装配件（非原车配件保险公司不予赔付）和交警的出警费用保险公司不予赔付，大约2500元想让我承担这笔费用。如果我不承担这笔费用他就不予支付我修车费。对方的意思是拿着发票报了保险6816元之后退去2500元剩下的4316元给我之后结案。我觉得这笔费用我不能承担，但我不承担保对方又不给我赔偿款。给对方发票等材料后保险又是直接把赔款打对方账户，主动权在对方让我我不得不承担。请问律师这笔费用我需要承担吗？如不需要我要怎么才能不承担这笔费用之后拿到全额赔款呢？