农村自建房办证问题

1、农村，父亲现名下有一栋两层半房子。96年起第一层，占地面积约110平，第一层证件手续齐全，2008年加第二层，无手续。2017年屯边修建公路，本屯及附近屯被化成规划区，但无正式文件通知。2018年3月15日征地拆迁办公室出征地公告，公告不得起房种树，本屯在公告村的范围内，但没有明细具体屯。请问若今后征收，2010年加盖的第二层是否会得到赔偿？
2、大概情况：本人2016年10月登记结婚，由于家里户口有9人，住房严重不够，故2017年7月开始申请当地测绘所测量土地，建房地方离修建的公路的距离大于200米，7月-12月之间得到测量土地3次，由于测绘出图时间过长，到12月2日才把需要办理开工证的所有资料（全部符合建房资料要求）凑齐并提交当地国土建设局，申请办证，仅被告知申请时间1个月。提交资料后家里开始打地基。2018年1月2日去当地国土建设局，被告知开工证已停办原因是被规划了不给办了（没有明确文件通知）。期间一直跑国土建设局，一直未遂，接着就到了3月15日征地拆迁办公室出征地公告。
地基起好了，请问这个房子还能不能继续起？办不了开工证没有建房证，那还可以办什么证以便今后可以维权使用的？听说唯一住房证明可以办，但是否在这种情况适用？办理唯一住房证明的条件又是什么？