农村老房子后院新法规怎么规定

老房子几代传下来有近百年了，前面L形状6间左右面积房子+1间大小的院子，是有土地证的，挂在我爷爷奶奶和爸爸三个人名下，三个都去世了，就我妈是农村户口，我们两兄弟九十年代初就买了城市户口，后面2-3百平方院子是没有土地证的，但是一直有围墙围着的。在危房改造的前几年就把老房子拆了重建前面就造了坐北朝南3.5间和大一些的前院，后面还是一样。现在村里在搞危房改造，我们老房子是之前拆的所以少的面积不承认，院子好像也不属于我们了，规划图纸直接在后面画了两间地基报给了镇政府，这两间地基一半在我们院子里面，他们意思规划算规划，造不造房子那是另一回事。我想问我们自己的权益到底有哪些，怎么保证。