去年毕业入职时跟公司签订了培训协议，今年公司重组，请问培训协议是否有效？

2009年7月毕业入职，跟公司签订了培训协议，协议规定：培训费用3万元，如果在职未满3年，那么按照 3万*（待在职年限/3年）赔偿公司违约金。
2010年4月2号公司重组，原来公司占有19%股份，新公司启用新的品牌，并完全独立与原来的公司。
新公司没有跟我们具体人员进行协商或者重新签订合同。2010年6月我提出辞职，公司人力告诉我，我需要赔偿1万多元的违约金。
请问：公司重组以后培训协议是否有效？我应该如何避免或者减少这笔高额违约金？