户口姓名变更凭户籍证明残军证能变更名子吗

我从小有两个户口，一个农业一个非农业户口，姓名不一样，后来参军用的是农业户口，因在部队负过伤，退役后民政部门评为七级伤残军人。因退役士兵农业户口的不给安排工作，只好用非农户口的名子就业。因名子不一样两套档案也不能合并，最近在地方整顿户籍中。要求两个户口注销一个，因非农业户口涉及社保等档案较多。注销了农业户口(也就是当兵评残的哪个)，派出所并给出据了二个户口为同一人的户籍证明，请问凭户籍证明我的残军证能变更吗。