房屋被非法强拆后，该怎么合法保护自己的合法利益？

可以要求赔偿的

先回答关于建设医院的项目改为建商品房的问题，这是偷天换日，地方政府在向省级政府申请用地时，打的旗号是为公益事业，当省级政府批准后，又把公益事业的项目私自改为商品房建设。这就是我讲的偷天换日，欺上瞒下，是违法的。
根据我的经验，凡违法占地欺上瞒下达到搞建设项目的行为，背后几乎都有腐败在作祟，只是有的明显，有的隐蔽，有的已经被揭露出来，有的还没被揭露罢了。
因为征地拆迁本身不合法，也就谈不上依法合理安置补偿的问题。

您好：
土地征收应当由省级以上部门批准，当地征收部门公告补偿标准以及补偿方式，协商签订征收协议并赔偿，对农民进行安置。如果不符合规定就违法，建议您聘请专业拆迁律师通过要求政府信息公开、行政复议、行政诉讼、谈判、媒体公开等多种方式来维护你们的合法权益。详情可来电来访。