运输合同是否生效

工程车辆运输合同
甲方：平原至凤凰公路施工队，工地负责人：刘德明，以下简称甲方
协商，自愿达成如下协议：
乙方：杨昌明 余春方
甲方在温水平原凤凰公路路面硬化施工中，需运输块石、石籽、石粉等施工材料，结合本工程具体情况，确保工程顺利完成，本着互利原则，在公平、公正的基础上，甲乙双方友好
运输至坝上35元/立方，超出该路段40元/立方。
乙方必须保障甲方工地施工材料运输，服从甲方管理人员管理，甲方每月与乙方资金结算，乙方必须保留第一个月运输费的30％作为押金，如乙方不能保障甲方工地施工材料的运输和驾驶员不服从管理的不予退还押金。
乙方必须做到安全运输，如造成安全事故由乙方自行负责。
本协议一式两份，甲、乙双方各执一份，双方签字后生效，双方共同遵守。
甲方：
乙方：


附注：
起点为平原至凤凰公路路口外，四公里内不加运费。 工程负责人能单方面的私自 减去运费吗？

是这样的，合同内容《工程车辆运输合同
甲方：平原至凤凰公路施工队，工地负责人：XXX，以下简称甲方
协商，自愿达成如下协议：
乙方：XXX
甲方在温水平原凤凰公路路面硬化施工中，需运输块石、石籽、石粉等施工材料，结合本工程具体情况，确保工程顺利完成，本着互利原则，在公平、公正的基础上，甲乙双方友好
运输至坝上35元/立方，超出该路段40元/立方。
乙方必须保障甲方工地施工材料运输，服从甲方管理人员管理，甲方每月与乙方资金结算，乙方必须保留第一个月运输费的30％作为押金，如乙方不能保障甲方工地施工材料的运输和驾驶员不服从管理的不予退还押金。
乙方必须做到安全运输，如造成安全事故由乙方自行负责。
本协议一式两份，甲、乙双方各执一份，双方签字后生效，双方共同遵守。
甲方：
乙方：


附注：
起点为平原至凤凰公路路口外，四公里内不加运费。》 工程的负责人想要减掉10块钱运费，我不同意，像上述合同能让他减掉运费吗？

合同生效的。合同履行按照双方约定或者协商，协商不成按照合同约定处理。按照合同，对方不能扣除的。