被人打成轻伤后

我于13年十月下旬，在工厂自己的车间里上班，与其它车间的车间主任因工作的事发生口角，吵完我没理，就转身走回自己工作的位置（是对方到我的车间里）对方乘我不注意，在地上捡起工作用的铁锤从我后背砸了过来，后背被打到后，我人就直接躺下，他又冲过来，用奉头打我的头部，当时就有同事报警，我被120送到医院，报警的两同事跟对方都被叫到派出所录口供，工厂里交了保释金后，对方下午就出来了.我到医院后，检查的结果为，腰椎L1.2横突骨折，多处软组织挫伤。派出所的民警第二天就过来调查，并且给了一份伤情鉴定书。在医院里住了20天后出院休养，于去年12月下旬，去市公安局作伤情鉴定，这个月中旬出了结果，鉴定为轻伤。当时派出所民警通知我去签字，然后告诉已立案，会把风案件移交检察院等通知，当天晚上，对方就打电话过来，说协商下，我没同意，说第二天在讲，第二天他来我家，跟我协商，然后讲，就赔点护理费，伙食费什么的，（医药费在我住院期间，我让他付的），误工费什么的，就厂里发，他算揩点工厂里的油。不给了，当时我没同意，就告诉对方，等到检察院的时候在协商吧，我们协商不了的。
现在我想问下，
 1.请问这个案件现在是属于公诉，当时没有提民事赔偿会不会有什么问题。
 2.对方现在还会被拘留吗
 3.住院加自己在家休养的时候现在快三个月了，今天工厂说，这是属于我与我跟他的私人事件，不算工伤，不给发工资。（我的工资是固定工资），请问工厂里发工资跟民事赔偿有关系吗？工厂这么做，合法吗？