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母亲1993年从生产队买了1.35亩边角地。捡砖拾瓦，历时8年盖起了饭馆旅社，开业不久生下妹妹。因跟父亲生气加之生活无人照料便抱着妹妹带着8岁的我回了娘家。后又因我跟妹妹的学业，辗转新疆、甘肃、山东、北京。2013年我大学毕业，母亲陪我回到原地发现以上房产已被他人侵占，现由市人民政府组织经营。如果我现向法院起诉，是起诉国土资源部门还是起诉该房产经营者？请各位律师给我指点。