这样的土地价值依法应该怎样评估？

刘律师，您好！先谢谢您了。有这样一个问题咨询您一下：
2002年以前的国有小厂，有的土地是1986年以国家划拨价付费取得的，另外还有后来改制为有限责任公司以后以协商价转让过来土地。2002年企业改制为由企业员工持股改制为有限责任公司。2003年上级机关要求每股以低于1.5元元把股权转让给某集团公司。股东们认为转让价是相当于2003年的价格，实在太低。要求重新评估资产，上级机关认为历史上国家划拨价取得的土地不能按现在的土地市场计算。股东们认为，改制后的有限责任公司已经告别历史的计划经济体制，以全新的有限责任公司融入了市场经济，因此，有限责任公司的一切资产都应该按适时的市场价值计算。土地也不例外。 
这样的土地价值依法应该怎样评估？ 
我是个小股东，热望得到帮助，先谢谢了。