违约辞职

我是2011届护理本科毕业生，2011年1月通过锦州某三甲医院人事考试，成为在编护士。2月提前上岗。同时参加了全国统考研究生考试，2011年7月被某大学录取。当时和医院协商保留编制读研，医院同意了，并与我签了《攻读研究生协议》。协议上规定保留院籍停发一切福利待遇及工资。医院按规定缴纳保险（医院承担医院部分，个人部分我自己承担）。此外还要向医院缴纳工作未满三年的补偿金5000元/年，分三年付清。这个钱规定我回去上班时会返还给我。当时我交了第一年的补偿金及个人部分保险，医院交了医院部分保险。后两年，医院没有催我交我就没有交补偿金及保险，而医院也没有交医院部分的保险。此外协议还规定：读研期间一切费用自理，我毕业后需服务期7年，如果申请调离需要经医院同意，并交回三年补偿金15000.还要交服务未满7年的违约金5000元/年。我的问题是：这个协议合理吗？现在我研究生即将毕业，如果我想要辞职，真的需要交那么多的钱吗？还有，如果我按协议返回医院工作，可以要求补发基本工资吗？期待您的回复，谢谢！