收到假发票又没法取得真实发票怎么办

会计以前没有经验收到假工程费发票一张，金额较大。已经入账。几年后会计内审的时候发现了这张假发票，于是和当时经办人联系要求对方单位重新开具，结果发现对方单位已经注销。当地税务局说只有对方单位法人去申请临时税务登记证就可以在税务局代开发票。但是由于我们公司欠这家单位关联企业工程款，所以对方拒绝重开。会计把这件事报告给了公司领导，并提出了是否单位自己交税找税务局开具发票，但是公司领导拒绝了，也没有要求在账上和所得税上做任何处理。
请问，如果税务局查到，是否会以会计过失而要求会计交纳工程费的营业税所得税和利息滞纳金。