父母离婚，把一处平房给子女。怎样办理最合算？且具有法力效益

父母离婚两年，离婚协议上把房子给我和姐姐，但一直没有办理任何手续。两年来一直是我和妈妈居住，父亲在外打工，但今年父亲回来，且再婚。现在要求住房子。可我和妈妈并没有另外的房子，而且房产证上是父亲名字，他又要住进来，为了避免以后有卖房，拆迁等问题，我和姐姐觉得应该办理相关手续，请问哪种方式最有保障且能够省钱。房子价值大约40万。