法院对被执行人的这种行为，应该如何处理？

事情经过：甲利用各种手段和理由阻止乙建房，乙最后不得已，诉诸法院，经过法院调查、审理，认为甲存在侵权行为，判决甲不得再阻止乙建房。在判决书生效后，甲（非甲本人，而是他的家人、亲戚、朋友）仍然阻止乙建房，乙请求法院强制执行，保护自己的合法权益。但是，法院以阻止乙建房的不是本申请的执行人（甲），拒绝了乙的强制执行申请，导致乙无法继续建房。请问，在这种情况下，法院的做法是否合理？法院的判决书是否还能起作用？乙该怎么办，才能保护自己的合法权益？谢谢。