交通事故赔偿问题

尊敬的律师：您好。有个问题想咨询一下。我的车辆在8月份被一辆大货车追尾，发生了交通事故，经交警裁定由肇事方负全责，并由肇事方赔偿我的全部损失（交警队也下达了事故责任认定书）。后肇事方同意将车辆拉到修理厂修理，修理厂是由肇事方选择的，为了保证正常修理，甲方（本人、交通事故受害方）乙方（肇事车主）丙方（修理厂负责人）协商签订了协议，一，乙方自愿赔偿甲方所有损失。二损失赔偿包括甲方的修车费用、配件费用及医院检查费用等各项损失赔偿。三，丙方将车辆修复后，乙方必须无条件支付车辆的修理费及配件费。四，凡违约方需按总费用的30%付违约金。现在车修好一个多月了，丙方扣着车不给，因他和肇事方因修理费用扯皮，肇事方不付修理费用。丙方又不起诉肇事方，他反而申请当地法院把我的车做了诉前保全，修理费大约是4万元，而我的车是16万元的车。我们三方是有协议的，修理费由肇事方付，我又不欠修理厂的钱，请问：修理方和法院这样做合理吗？他们应当承担什么过错？我该怎么做？