债权、债务冲销

公司是做生产资料供应链业务，我公司（供应部）享有对A公司的债权（财务所讲的“应收款”，供应原料给A公司，”合同中约定甲方：我公司，乙方：A公司“。）同时，公司（销售部）负有对A公司的债务（财务术语的“应付款‘，我公司采购A公司产品并进行市场销售。”合同中约定甲方：A公司，乙方：我公司）目前，公司拟与A公司想通过一份协议，将债权、债务进行冲抵。（冲抵协议内容大抵情况如下：甲方：A公司，乙方：我公司，然后罗列具体合同项下的双方债权（债务）情况， 这样的情况下，势必造成协议的法律关系主体和原合同主体相悖，造成法律关系混淆？（因在协议中甲乙方与供应合同中的甲乙方约定恰好相反），如果避免这种情况，冲抵协议该怎么表述最为准确？
双方增值税专用发票都已经开具，造成财务两头挂账金额较大。所以才想到这个办法。