关于农村房产过户

我是温州农村的，父亲4兄弟合资建造了一栋房子，共4间5层，一楼大厅，2.3.4.5都是套间，每层两个。每户人家分到2个。然后当初建造时因为各种原因，我家的两个和我大伯的两个套间是都在我大伯名下的，我父亲另外两个兄弟的房产都已经分开独立了。现在就我家和我大伯家的套间。都属于我大伯名下，现在我父亲想把属于我们的家的两个套间从我大伯名下独立分出来，以免以后有产权的纠纷，请问下这是要办过户吗？需要准备什么材料，要哪些人去，手续费如何，大概要多少时间审批，是否好办，因为我家兄弟姐妹比较多，属于超生，交了部分罚款，还有部分罚款未理清楚，不过这是十几年前的事了，会对我们过户有影响吗？