商品房

男方和前妻有一套房改房（第一套），婚姻存续全款购买。男方和二婚妻子结婚前购买一套商品房（第二套），婚后还完了全部贷款，首付款和贷款全是男方个人出资，该房房本是和现妻结婚前拿的，房屋档案也只有男方个人名字。男方婚后和现在的妻子共同出资购买了一套商品房（第三套），并有一份各自出资多少的协议，婚后夫妻双方签了AA制协议，离婚时女方反悔，该房目前还没有房产证。男方第三次起诉离婚后，法官组织了一次调解，女方在庭审笔录上签字按手印同意离婚，男方因房产分割分歧较大没有签字。请问离婚时法院会怎样处理这些房产？