求助关于应届毕业生的档案&户口转移问题

背景：
1. 南京的学校、本科2015届毕业生，原籍：贵州、农村户口。毕业后打算先在南京找工作几年，但是无长期在此的意愿，打算以后去重庆或者贵州工作，在那边定居。
2. 学校毕业流程：找公司签三方协议，才能拿到报到证、户口迁移证，学校根据协议填写户档迁往地，凭报到证、户口迁移证办理档案和户口转移，学校户档不分离，必须一起转移。转移方式主要有以下几种（以下忽略进国企、事业单位等情况，仅从本人毕业在外找工作来说）：（1）找到工作的毕业生按协议转到接收户档的公司（如无接收权则是接收给我们放到他们合作的人事代理机构，像南京市人才），（2）转回原籍，原户籍所在地县（或市）级人事局。（3）公司不收自己交钱挂江苏省高就（此项本人无此打算）。

（以下“公司无接收权但公司同意接收”按公司将我们的户口档案挂靠公司合作的人事代理机构处理）：
咨询：

1. 和公司签了协议之后，学校按协议填写报到证和户口迁移证的去向，那是不是此时只能按报到证将户口&档案转移到公司（合作的人才），而不能将户口和档案迁回原籍（其实我是考虑能不能把户口迁回原籍，但是户档不分离，一转移就是一起的）？
这个问题本身就很矛盾，学校要签协议才发报到证，报到证发了就得去公司报到转移档案和户口到那儿，那这怎么迁回原籍？想迁回原籍就得没有协议约束具体的公司去向（我总得找工作啊），那这样不签协议还怎么拿报到证（还有不签协议没有报到证那我以后哪来的干部身份、工龄这些），不拿报到证怎么回原籍办理户口档案转移手续？
2. 如果转移到公司了，那么户口成了集体户口，据说这只是一种这个城市的临时户口，那么这种集体户口是不是不好，据说不是算这个市的常住户口，很多常住人口的政策、福利将会不能享受，还有就是这种集体户口会影响到以后结婚、生子、子女上户、就学等问题。也就是说我们大学生这种“非农”户口既成了“非农村”也是“非城市常住”，两头的优惠政策都沾不着。这一点究竟是怎样的呢？
本人无在南京买房定居的打算（太贵），想以后回贵州或重庆买房（如果有经济能力），那么这个集体户口对于以后我去那边工作、买房、定居有何不利影响吗？
3. 如果和公司签了协议，也可以办理将户口和档案迁回原籍（如果可以的情况下），那么回原县里办理的时候这个报到证有效么？能在县里人事局办理档案手续么？因为报到证上报到去向是（学校根据协议）公司。
还有这个报到证到公司报到之后报到证会被收么（作为材料）？还是只是看一下而已，会还给我自己，因为万一公司收了而我的户档转回原籍去那边办理的时候就没有报到证了。
4. 如果户口和档案转回去了，那么我在南京市的公司工作，公司这边的社保和公积金（若有）能缴吗，有影响吗？是不是必须要户口档案在公司所在地，公司才能正常为我缴纳社保和公积金（若有）？
如果可以正常缴纳，以后我在这边几年后离职去重庆找工作，那么我这边的社保和公积金（若有）能否转移到到重庆那边？我的户档也还是在原籍，有没有影响？
5. 如果我的档案和户口转回原籍了，不在南京市，但我在南京的公司上班，那么我干部身份和工作一年后转正定级、计算工龄以及以后职称评定是否会受影响？这几项是否跟档案户口在哪儿有关？是否必须户口&档案在工作公司所在地才能确立干部身份、转正定级、计算工龄、以及以后职称评定？
6. 户口和档案转回原籍去了，档案我知道是在县人事局，那么我的户口会怎样处理——
（1）户口回原籍是在那边人事机构/人才市场挂的集体户口吗？（如果回原籍也是集体户口，这样的话不就是和在南京的人才挂集体户口差不多么）
（2）还是说回原籍会给我把户口落在乡镇，给我一个户口本，独立办一个户口（非农）？（这是听我朋友说的）
大学生户口迁出来就是非农了，据网上了解此时非农想转农办不了或者很棘手。我的户档回原籍了，我可以将我的户口挂回原来爸妈的那个户口本上吗？也就是转回我的农村户口。如果想转回农村户口需要向乡镇派出所或公安部门怎么申请？听说还需要村委会意见同意入本村户口才行？这样可以吗？村委会意见找找关系应该没问题。就是想知道转回去有没有机会能回到原来迁出来的户口上“复原”？

这两天在网上已经查看了很多关于毕业生户口档案转移到问题，但是都没有遇到类似以上问题的解决方案。特此求助各位知情人士给点意见和建议，小弟不甚感激！！！