我想咨询下违章建筑的问题，原来我们私营企业因为拆迁而向镇政府提出需要地方建厂搬迁

我想咨询下违章建筑的问题，原来我们私营企业因为拆迁而向镇政府提出需要地方建厂搬迁，镇政府也答应了，后来搬到现在的地方建了钢架厂房，建厂时，区国土办来要求罚款，我们也罚了，现在过了几年镇政府被撤销了，而区政府 好在说是违章建筑，这个算违章吗？现在有原来和镇政府签订的协议，也盖章了，也有区政府原来的罚款交款单，村委会也有租赁合同。