2010届毕业生咨询户口迁移问题（紧急）

各位老师好。我是河南生源，2006年考到北京某高校，户口也转到了学校。2010年毕业后学校开了报到证、户口迁移证等。报到证上面写的是河南省安阳市人事局，但是我想把档案和户口都挂靠到郑州市人事局。所以我先去郑州市人事局开了接受证明，然后去安阳市人事局报到取了档案；当时我问他们户口迁移证怎么办，他们说跟他们无关。之后我把档案放到了郑州市人事局，办理了人事代理。当时由于一些急事，我来了深圳，所以这些都是朋友帮忙办理的。 现在我要办港澳通行证，结果朋友告诉我说只把档案和党组织关系放到了郑州市人事局，户口他们不接受。
这样的话我很着急，已经过了有效期了吧，会不会成为黑户？另外，现在要补办的话怎么落户？有什么程序和文件？我还想办户口落到郑州市，因为我现在即使落回原籍的话，也是非农业户口了。
这件事真的好纠结，希望各位老师能给与指点。谢谢。