关于离婚的问题

我想咨询一个问题：我的父亲和母亲目前共同拥有2套房产，并各自开有股票帐户，炒股为各自操作，互不干扰。
最近这两年，我的父亲在外面PIAO，并与一女人在外同居。这些事情都是他自己说给我母亲听的，并对我母亲表示那个女的愿意等我母亲死了再进门。但是他很狡猾，从来不和那个女的在公开场合走在一起，而且目前我们还无法找到那个女的住的地方。
我母亲是一位很贤惠的人，我父亲家里很穷，年轻时候帮着我的父亲供养老人和我父亲的兄弟姐妹，都没有怨言。5年前患上肾衰竭并换了肾，现在身体状况还算相对稳定。最近这段时间，父亲长期夜不归宿，还名目张胆的带着那个女的到处去玩，对于我父亲这样的过分行为我母亲坚决要求离婚。
目前，我们（我母亲、我、我姐姐）想和父亲谈判进行协议离婚。想请教一下要进行谈判，需要什么准备工作？我们打算如下：一是将目前的财产（主要是房子）进行估价并谈一个分配比例；二是明确两人自己的股票帐户作为个人财产，不重新分割。这样是否合适？此外，就是想问一下这种协议商讨是否需要找证人在场更好？我们打算找我父亲的妹妹和母亲的姐姐到场，这样是否合适？有没有法律效力？因为我们怕我们作为子女在场没有法律效力。如果协议不成，我们就打算想法院起诉，请问最好采用什么方式？在这件事情上我们能采取哪些措施为我母亲争取到更为公平的待遇？