行政作为四年后有异议的怎么办

四年前，畜牧工作站工作人员对养畜户的牲畜进行检疫。其中一人在跟站主任协商完后离去（或许交了钱）。四年后，当时的工作站主任去逝，当时那个养畜户组织十多余人，找到当时的工作人员，编造谎言，串通口供，说当时是这个工作人员伙同其他一个人对他们进行检疫，收了他们的钱，却没开票，要求这个工作人员返还交的钱和一些什么损失费。当时的检疫费有的是主任收的，有的是工作人员收完给主任的。现前任主任去逝，死无对证。这个工作人员该怎么办？是否会冤枉的背上罪名？ 
不知那些人要走法院还是纪检部门，这些部门不会被他们给蒙骗了吧？