关于若干个体户及有限公司如何整合问题

您好!请教专家：
我一个朋友，有两个个体户的诊所，一个有限责任公司医疗机构，主要情况如下：
1、现在这三个主体的股东各不相同，朋友在两个个体户占都是占股三分之一，有限公司占股二分之一；
2、现在从问题是：从三个主体的内控、管理、业绩上来看，都出现了问题或者说遇到了瓶颈；
3、个体户这个主体还有的问题是：以我朋友个人及另外两个股东个人名义买了经营门面和住房，但钱是这几个股东出的；做账又做到个体户帐里面了；
4、朋友在个体户与其他的股东之间没有有效的法律手续；
5、个体户和有限公司账面有对外几家单位的投资，但投资合作协议的主体是我的朋友；
6、朋友现在另外注册了一个新公司（或者说壳公司，2013年11月底成立，未经营），他想把上述三个主体的股份梳理一下（三个主体的股东比较好梳理、退股或者转让、我朋友回购都可以），想全部统一装到这个新公司里面或采取其他合法手段，打造一个大的平台或者统一的平台；

请问：
1、具体操作是以分公司形式还是子公司形式来装？还是以另外的持股平台形式把原三个主体的股东梳理后分别装到不同的持股平台再反过来投入这个新公司？
2、朋友现在本来打算想众筹融资，但鉴于目前的情况，不敢融资也无法再融资后进行有效管理等，能否结合问题1来解决？
    以上问题请专家给与详细解答，非常感谢！