有关一起车险纠纷

不久前我叔叔开车在高速路上因为一辆车追尾导致车（家用）受损，交警的处理结果是责任在对方，交警评估人员给出的意见是一万元左右就可修好受损车辆，于是，在交警的协调下，以对方付给我叔叔一万元修理费“一次性解决（这是责任认定书上的原话，我总觉得有点不合法律程序）”.然后对方的车入得有车险，对方也说愿意承担我叔叔修车的全部费用（最后由他这一方的保险公司赔付），但对方的保险公司说只有在4S店修理才能报销全部修理费，于是我叔叔就把车送到了4S店修理.
现在的情况是，车已经修好了，但是总体费用不是原来交警评估的一万元，而是两万二千元（可能4S店修理费太贵），而对方的保险公司说只赔付交警的责任认定书上的评估费用，也就是一万元.
现在车修好了，也等着用，我叔叔肯定不想自己掏那多出的一万二千元钱，对方（即追尾司机）也好像不太情愿拿这个钱，他的理由就是责任认定书上已经标明了一万元一次性解决.
所以，想问问各位熟悉保险或法律的朋友，这个事情应该怎样解决，谢谢了！