咨询两家关联企业经济问题

我和合伙人开设2家企业，我持股49%，合伙人持股51%，法人代表全是我；我负责一家企业运营，全部都是我独立自主，他从不过问，我控制的企业规模较小，用合伙人负责的另一家企业会计负责代帐，他控制的企业也是他独立自主运营，平时我均不过问。现在他负责的企业运营情况不理想，他的会计由于有我的企业网银和财务章，就把我企业对公账户的钱全部划走了，只支付我公司员工工资和日常开销，累计在我不知情的情况下划走我100多万。现在我们之间有很大的矛盾，请问他的行为是否合法，我能追究他和他的财务什么责任？我公司公章和法人章全部在我这里，我查了网银流水，从我这里调走的钱全部以借款名下搞到合伙人个人名下去了。