广州黄埔乌冲出口被查验 导致船公司产生大量柜租

我司为一货运代理有限公司，15年11月底1个集装箱安排给一报关行安排报关（买单），
客人（贸易公司）提供的信息清晰完整不涉及到任何仿牌之类，

该柜子报关行完成报关后放行，但不知何缘由，海关做出放行后查验的指令，

于是进入了漫长的等待，期间海关进行了查验，但货物产生了货损（报关行说是查验后装卸工人装卸不当导致）

之后报关行又说需要换柜才能解决问题 即提出一空柜，将原来的货物挪出原集装箱并搬入此空柜再安排出口，

事情才算最终得到解决，

请问在此期间，由于查验导致船公司产生的大量的柜租，以及货损应由谁来承担