拖欠工程款

最近真的很苦恼不知道该怎么办，工程造价是3000万的，我们还另外交了1000万的保证金，现在工程已经完成百分之九十八。到现在只拿到1000万工程款，现在连我交的保证金都想不给还。现在还出现一个严重的问题 。  
1:这个工程是邵某接得他要我们入股，本来大家说好让其中邵某当法人代表的，可是邵某骗我们把法人给他妹妹的女儿的老公当法人（我们是在工程动工时候才知道不是邵某当）.
2:他在前期给我们看的他跟甲方定的合同上面没写100天完工（要是写了100天完工我们绝不会入股，谁都知道100天可能做的完3000万的工程吗？在说价钱也不是很高。）这合同还是最近我们才看到的。
3：我们跟邵某的入股协议中提到，有什么变动要大家商议，邵某在不我们不知道的情况下跟甲方签署了拖工期一天陪10万元，上海环球国际金融中心在拖工期上也是10万元一天的赔偿，人家是50多亿的工程，我这才工程3000万元白做还不够赔甲方呢.(这还是我们前几天叫甲方给钱时候，甲方告诉我们，你们还有钱拿吗？叫我们回去看看合同在来。）
4：我们跟甲方的合同中这样写到 双方约定的工程款（进度款）合同支付方式和时间：
   （1）承包人正式进入施工场地，发包人三日内支付三百万元做为承包人进场费用。
   (2)根据工程完成量，发包人陆续支付七百万元工程进度款给承包人。
 （3）整栋主体屋面混凝土浇筑完毕，发包人支付承包人总工程量百分之八的工程款。
（4）工程完工验收后，发包人支付承包人百分之十的总工程款。
（5）工程结算经双方确定后，发包人支付承包人百分之七的总工程款。、
（6）剩余百分之三工程款作为工程保修金，待保修期一年期满后，发包人一次性支付给承包人。
现在出现个邵某在我们不知道情况下又跟甲方签署全额投资（工程完成后验收合格给钱），这完全是邵某跟甲方又一次串通好的。
       现在甲方抓住工程工期上面做文章不在付钱给我们，还反过来说我们耽误他的工期，要求我们赔偿，我现在连死的心都有啊。工程款不给就算了，连我们打给甲方的1000万押金的都不给还。现在这个问题怎么处理都不知道。起诉邵某吧，到时候闹乱了，甲方更加跟邵某理应外和的玩弄你。起诉甲方吧，他态度变来变去的，一下说给一下说凭什么给你，动不动跟邵某搞些什么合同出来。