婚前合资买房，分手后该如何处理？公证处不给予公证怎么办？

律师你好。我跟女朋友在婚前合资买房，我出的钱要多一些，出了10万，她出了4万一起付的首付。我是主还贷款人，她是此还款人，但房屋产权各占50%。现因感情不合分手，应该按什么流程处理房屋产权问题，目前房产证还未办理下来，估计三年后才能办下来。另外，如果在房子这个事情上，她不配合协商，我是否可以走法律程序，应该如何走？我们私下已经协商好，并有了书面的协议，准备将此协议拿到公证处去公证，但公证处不办理说没有房产证，像这种我们私下已经协商好的情况，如何将他合法化或者使我们书面协商的东西具备法律效力。
我担心的是，现在协商约定好，以后双方都同意了。以后她又反悔怎么办？或者说当时的书面约定，是我威胁她签署的怎么办？所以我现在就用法律的方式，把这个事情法律化。我希望能有第三方介入公证，不然到时候产生争议怎么办？仅仅两方签字到时候说不清楚