关于土地征用的问题

您好！我想咨询一下关于土地征用的一些问题。
   我在老家有4亩左右的土地于2008年被当地政府占用，除去我家以外还有十数家也同时一起被占，当时政府解释说是为了当地经济的发展，准备把土地以租用的方式先从农户的手中拿过来推平后，再引进投资商建厂，合同上规定，在土地正式被征用后再对农户按当地土地的时价进行赔偿，而在征用之前一直就以租用的方式对农户进行赔产（田800斤/亩，土地600斤/亩谷子），但合同上没有写明征用时间。
   现在时隔4年，土地早已推平，且已经有一家厂房建起，但我去找政府，他们给我的解释是土地是租用给厂方的，并未卖出，所以仍然一租用的方式对我们进行赔产，但当我问他们具体征用时间时，他们推脱是因为上交到重庆的申请未通过，不能给出确切时间。
    而合同是我父亲所签，我父亲是户主，但是我父亲识字不多，因为年过六旬，视力下降，且是在夜晚的情况下所签，而在我们多次找政府后，政府又强行补签了一份土地流转协议。
    我想请问下，这份合同是否有效？政府的做法是否合理？