拆迁还建分歧

您好。09年我母亲去世，去年我和父亲去房地产局做了房产切分。因我是家中独子，因此按照继承法，把父母名下的一套房产进行了划分，我名下是25%，父亲名下为75%。房产证各一本，土地证则共一份，原因是房产局工作人员说因房子是一套，无法划分各占哪一部分，所以只对占比做了注明。户口本我和父亲也是分开的。目前房子所在地将拆迁，拆迁公司认为我们只有一本土地证，而不管几本房产证。因此只能按一套房予以还建，而不是我和父亲各自还建。分歧就在这。请您指导。