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第一章 总则
第一条 为进一步放开放活研究所，建设符合新体制特点的研究所运行机制，特制定本条例。
第二条 研究所实行所长负责制和所长任期目标责任制(条例另定)。所长全面负责领导研究所的业务、行政工作。
第三条 所长必须认真贯彻民主化、科学化原则，充分运用各种民主管理形式，搞好工作，要支持、关心党委、职工代表大会的工作并接受其监督。
第二章 所长的条件及任免
第四条 所长应具备的条件：
(一)具有良好的政治素质与政策水平，坚持四项基本原则；
(二)具有高级专业技术职务，有与领导研究所相应的学术水平和较强的组织管理能力；
(三)能根据客观实际提出研究所发展战略以及改革的方案，具有办好研究所的强烈事业心、责任感和勇于开拓的改革精神；
(四)有全局观念，办事公正，作风民主，善于广泛团结干部与职工；
(五)身体健康，能坚持在科研管理第一线工作，年龄不超过60岁。
第五条 所长由院长任免，向院长负责。
第六条 所长任期4年，可以连任。
第七条 所长在任职期间可以申请辞职，事先向院长提出书面报告，经院长批准后方可生效。
第八条 所长在任职期间表现明显不称职或有严重失职行为，院长有权免去其职务。
第三章 所长的职责
第九条 所长的职责：
(一)所长必须贯彻执行党和国家的有关方针、政策、法律、法规和院的规章制度；
(二)所长应在全院方针指导下正确掌握研究所的业务发展方向，制定规划、计划并组织实施；
(三)所长应努力提高研究所的研究工作水平和业务管理水平；
(四)所长应加强研究所与社会的联系，努力为社会经济发展服务；
(五)所长应努力提高本所职工素质，积极培养、选拔优秀的科技管理以及其他方面的人才；
(六)所长应努力改善本所职工的工作条件和生活条件，正确处理国家、研究所、个人三者利益的关系；
(七)所长应坚持两个文明一起抓，结合业务做好思想政治工作，加强本单位的社会主义精神文明建设并作出表率。
第四章 所长的权限
第十条 所长在研究所权限范围内行使业务、行政的管理权、决策权：
(一)决定研究所的业务发展方向、规划计划、课题设置；
(二)提出任期责任目标并组织实施；
(三)决定经费和科研器材的分配；
(四)在有关规定的范围内决定职能部门和研究室的设置、调整或撤销；
(五)提名副所长人选；决定中层以下(含中层)干部的任免；根据有关规定聘任各级专业技术人员；
(六)决定职工培养计划；
(七)决定对职工的奖惩；
(八)决定国际科技合作和学术交流事宜；
(九)决定本所各种规章制度的建立、修改或废止。
第五章 对所长的监督和考核
第十一条 研究所各种组织应保证、协助、支持和监督所长行使职权。所长行使职权应体现民主化、科学化原则，充分听取各方面意见，保证决策的正确性。
第十二条 有关研究所工作方针、学科方向及其他重大问题，应经所务会议或所长办公会议讨论。如有涉及研究所方向、任务等重大原则分歧，应将不同意见报院。
第十三条 所学术委员会是所长实施学术领导的评议、咨询和参谋机构，其职责是研究本所的学科方向和发展战略、评议全所科研成果、评议科技人员专业技术职务资格(后者或由另行成立的评委会负责)等。
第十四条 研究所职工代表大会定期听取所长工作报告，审议所长任期责任目标，审议通过涉及职工切身利益的重大问题的方针和原则。
第十五条 所长任职期间，由院干部局会同有关部门每两年考核一次。
对所长的考核，以任期目标实现情况为主要内容。
第十六条 所长在业务、行政工作上绩效显著并完成任期责任目标的，由院给予表彰。
所长因主观原因未完成任期目标，应向院写出检查报告。
第六章 附则
第十七条 本条例适用于院属各研究机构，各研究机构可根据本条例制定实施细则，报院备案。
第十八条 院属非研究机构，可参照本条例执行。
第十九条 本条例解释权和修改权归院。
第二十条 本条例自1988年11月1日起施行。1988年4月1日发布施行的《中国科学院关于院属研究所实行所长负责制的暂行规定》即行废止。
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