三个月前签订了考核任务100天未完成任务扣3000元，但是当时劳动合同有说明不扣底薪

既不合理也不合法。针对你的问题答复如下：

    1，建议向劳动监察部门投诉，必要时，也可以直接申请劳动仲裁，维护你的合法权益。
    2，具体做法如下：先向劳动监察部门投诉，然后，你再申请劳动仲裁。这样的话，你可以要求公司除应足额支付你工资外，还可以要求加付相当于拖欠工资25%的赔偿金。

以上答复，如果满意，敬请采纳。