报到证与人事档案

我2010年7月硕士毕业，在北京一家单位找到工作，但是没解决户口，不能接管档案，学校规定这种情况都把档案派遣到户口所在地的市人事局，我当时就拿着报到证去了市人才中心，我跟办公人员详细的说了自己的情况，然后登记填表了以后，他把报到证又给了我，让我送到县人事局。11月我在单位要签正式的劳动合同了，要求出具人事代理协议，我就托同学帮我去签了一份邮寄过来，上面写的个人委托单纯存档60元/年。
现在12年7月，我要评定中级职称了，需要档案机构出具档案情况证明，托同学去帮我办，结果答复说我的档案现在还是学籍档案，要需要我去县人事局把报到证取回来，再到他们人才那去另一个部门签订一个就业协议，一年后转成人事档案才能给我盖章。这样我就少了两年的工龄，而且评定职称也要晚一年。想问下就不能补办么，为什么非要按照签订协议的日期算，我已经在那办理报到了。。