宅基地纠纷

老师好，我想咨询一下，我家是农村，宅基地东侧有一条胡同，是我爷爷分家时在自家庭院里分出来的，后来因爷爷和大爷爷闹矛盾将胡同在中间堵死，这边一直由我们家使用，过去爷爷说东邻居在我们这边没有留滴水檐，都是我们家的，但年代久远，老的地契已丢失，爷爷已故去多年，老一代人所剩无几我们现在没有证据可以证明。后来父亲翻建房屋此胡同没有算在土地使用证里。大哥结婚时靠东邻居房房屋建有一车库，与东邻居无异议。后来东邻居将房子卖给另一家后搬走了，新邻居翻建房屋时和我们发生了矛盾，说我的车库占用了他们的地方，因没有房产证，村委认定胡同为公共用地，经村委协商我的车库重建向内移了40厘米，他们靠着我的车库盖得房子。2014年我翻建房屋，他们又要求我给他留50厘米滴水檐，还是因为没有房产证，村委协商我给他留了30厘米，因胡同不够建车库了，我将主房向里移了50厘米，村里还要求签了免赔协议。自那时矛盾一直不断，现在他告我违建，要拆我车库，村委不敢管。我该怎么办？