屋顶施工接近完成，施工合同变更是否可行？

请输入我住在顶楼，有阁楼，十年前曾把阁楼翻高，是违章建筑。今年我准备室内装修，就想把原来的违章搭建的屋顶拆除重建，恢复原样。五月份和一装饰工程公司签署一份阁楼加层改造合同，重做屋顶。合同总价10万余，分五次付款，首付30%，主体框架完工20%，这两部分款已付。现在工程完成封顶，准备支付第三笔20%款。（之后还有验收完需付的20%和完工后六个月10%的质保金）

由于之前签署合同时没有仔细审核，所以有些施工内容我想做一些变更：
1、原来为防止墙体渗漏，预备在与邻居相接的东西墙上进行注浆，这部分预算达到2万余。但在施工过程中，发现这两面墙是多孔砖制的砖墙，如果高压注浆，浆体会顺砖孔流淌，不会有防渗漏作用；而且，由于和邻居是砖墙分隔，高压注浆可能会破坏邻居墙面。因此，我准备取消合同里墙面注浆这一部分，也就是说合同总价这里想要减去2万余，不知是否可以？

2、原来合同里有天窗和窗户周边打胶处理预算近7千，由于是我自己买的窗户并安装好，这部分费用是否应从总价里扣除？

3、原来合同里屋面瓦是按新买的瓦55一平米预算，可是在施工中是用我原来的旧瓦来铺设的，这部分预算是否可以扣除？

4、原来合同里混凝土立方计算，乙方计算错误，应为8立方算成0.8立方，这部分差价是否应该补给他？还有个别材料预算不足，是否按实际支出补足？此合同为包工包料总承包。

5、鉴于上面这些内容，我准备和该公司签一份合同变更协议，对剩下的施工内容和需付款项重新定义，不知有哪些注意事项？如果该公司不愿变更，该怎样处理？如果因协商不成，我剩下款项不付，是否违约，该怎样做有利有理？

6、原来楼上楼下装修是放在一起的，我担心该公司的装修水平，只签了楼上的房顶拆建合同，不过另付了一万元作为室内装潢的定金，并在合同里注明乙方收取定金后需做部分隐蔽工程和拆旧，至今乙方没有拆旧更没有隐蔽工程，我是否可以在付剩余款项时对乙方进行约束？这一万块我不准备要了，因为在之前的施工中感觉不好，不准备让他们装修室内，但我想通过剩余款项的支付方式在变更合同协议里让乙方完成拆旧，不知是否合适？

大致就这些，望能尽快得到答复，谢谢。你的问题