遗产纠纷

我爸有三兄弟，二叔死的时候膝下无子女，后事都是我爸料理的，二叔就把他的所有遗产留给了我爸，遗嘱里写着所有财产给我爸，写的是我爸的名字。后来我爸得癌症死了，临死前没有留下任何遗嘱。我们家最大的遗产就是林场，在83年村委分林场的时候，我二叔的独立出来了所以他的林业证上是我二叔的名字，我爸的这本林业证上面有部分林场下面备注着和我三叔共有，等于我们家和三叔家的还没分出来，财产是共有的，共有的部分在林业证上有备注说明。现在我家手里的就是两本林业证，一本是户主我爸的，一本是户主是我二叔的（虽然是我二叔的，但有遗嘱写着归我爸了，就是没改户头）。后来在我爸死的时候，我三叔回来要求分林场，因为我和我哥都不知道我们家到底有多少林场，具体位置，还有林业证上面写的和我三叔共有的具体是那些，我和我哥俩兄弟觉得父辈就只有这么一个三叔在世了，也就觉得没计较那么多，三叔在我爸死了没几天就带着大队支书过来分林场，把所以林场一分为二写在协议书上，分给我们家的这份协议上面写着他同意这些林场归我们家，下面写着他的名字和时间还有大队支书的名字。分给他的那一半写着我们家同意这些林场归三叔所有，下面叫我们兄弟俩签名，大队支书签名，我们当时签了。这个协议是单独一份的，我们没有他那份的副联，我们家这份他也没留底，而且我妈当时身体也不好，都没参与这个事情也就没有签字。
后来他背地里把我们家的林场上的树卖了，中间和别人一起捞油水（比如一万的木头就说卖了两千给我哥一千他和别人合伙拿九千）。被我们家知道后，我哥就把林业证放了起来，他要求把林业证拿出来当初协议上写给他的户名换到他名下，我妈气的不给耗了4年，他现在着急了怕时间久了他什么都得不到了，就告上了法院，这几年来有事没事就找我家麻烦，还找外人来欺负我们家，所以我们家真的不想履行当初签的协议，我想问下现在他告上法院了，法院会怎么处理这个事情？是按法律程序走，还是按当初协议来分？