违反培训协议约定的赔偿问题

下面我简述下：我与A公司的劳动关系是通过B公司（劳务代理公司）签订的，上月我提出离职后，A公司就开始扣发我当月工资。我与A公司签订过一个培训协议，大致内容是违约需要按月赔偿。
我的问题有三：
其一、A公司的培训协议里面的培训内容是不存在的，我可以肯定A公司给不出任何培训费用的单据证明。
其二、我的劳务关系是通过B公司的，我直接与A公司的签订协议是否有效。
其三、假如协议是有效的，A公司是否有权从我的工资里直接扣除所谓的培训费用的赔偿金。